En los estatutos de la SEFH, norma de gobierno de la Sociedad, se contempla como objetivo general el fomentar y promover las actividades científicas, técnicas, académicas, funcionales y docentes del farmacéutico de hospital y, por regla general, de todo lo concerniente a la Farmacia Hospitalaria, en beneficio de los ciudadanos y la sociedad en su conjunto.

Para el cumplimiento de los fines expuestos, la SEFH, podrá organizar y convocar cursos, congresos, seminarios o reuniones de cualquier tipo, científicas o técnicas, dentro del campo de la Farmacia Hospitalaria.

La SEFH es una referencia obligada de los profesionales de farmacia de hospital, que responde a las necesidades de sus socios. Uno de sus principales objetivos es establecer sinergias de actuación con otras entidades y colectivos de interés como administraciones públicas, centros de investigación, sociedades científicas, asociaciones de pacientes, etc., en aras de fomentar actividades científicas y formativas en beneficio de la profesión farmacéutica y en consecuencia de la población en general.

La Educación, la formación, la innovación, el desarrollo, la seguridad y las publicaciones son diferentes áreas ligadas entre sí, que se desenvuelven en la Sociedad y que forman parte de las actividades diarias.